De structuur van de organisatie is belangrijk, maar de manier waarop mensen met elkaar samenwerken bepaalt uiteindelijk de kwaliteit van de organisatie. Maar de cultuur laat zich niet vastleggen in voorschriften of op de tekentafel. Cultuur wordt gevormd door de ongeschreven regels en de onderliggende drijfveren van mensen: hun verborgen motieven en principes. Deze zogenaamde stille waarden van de organisatie staan centraal in organisatiecoaching.

De coach beschouwt de organisatie als een systeem dat bestaat uit verschillende, onderling verbonden subsystemen die samen één geheel vormen. Deze subsystemen zijn van elkaar afhankelijk en veroorzaken zichtbare en onzichtbare patronen. Samen met de medewerkers zoekt de organisatiecoach naar deze patronen, die in de organisatie bespreekbaar worden gemaakt en daardoor ook veranderbaar worden.